تایپ توالی چند مرحله ای گونه های کلستریدیوم پرفرینوژنس از گوساله های نوزاد ، لبنیات و محیط اطراف در هند

کلستریدیوم perfringens یک پاتوژن زونوتیک شناخته شده در سطح جهان است. ما گزارش جداسازی و ژنوتیپ C. perfringens از گوساله های نوزادان ، لبنیات و محیط مرتبط با آنها در هند را نشان می دهیم. در کل ۱۰۳ نمونه مدفوع از گوساله های نوزادان ، ۲۵ سواب مدفوع از کارگران لبنیات و ۵۰ نمونه از محیط مرتبط با آنها از دو مزرعه لبنی جمع آوری شد. C. perfringens در ۲۶ از ۱۰۳ (۲۵٫۲ ۲۵) نمونه گوساله ، ۷ از ۲۵ (۲۸)) نمونه مدفوع انسان و ۱۷ از ۵۰ (۳۴ environmental) نمونه محیطی تشخیص داده شد. C. گونه های پرفرینوژن نوع A غالب در گوساله های نوزادان (۲۶/۲۴ درصد ؛ ۳/۹۲ درصد) و محیط همراه (۱۷/۱۵ درصد ؛ ۲/۸۸ درصد) بودند. در مقابل ، سویه های کارگران لبنی بیشتر مربوط به تیپ F (7/5 5 7/5 درصد) بودند که ژن توکسین بتا۲ را نیز به خود اختصاص می داد. هفده سویه با استفاده از نوشتن توالی چند مرحله ای (MLST) برای مطالعه رابطه ژنوتیپی همراه با ۱۸۸ گونه C. perfringens موجود از داده های عمومی مورد تحلیل قرار گرفت. در مجموع ۱۱۲ نوع توالی (STS) از ۲۰۵ گونه C. perfringens مورد بررسی قرار گرفت. یک مجموعه کلونال (CC) توسط سه ST (ST 98 ، ST 41 و ST 110) که به طور عمده از نوع F (سویه ۱۸/۲۰) نمایندگی می کنند ، بیشتر با بیماریهای انسانی همراه بودند. در بین ST های غالب ، ST 54 با موارد انتریتیت در پوسته ها و سگ ها و ST 58 همراه با انتریت نکروتیک در طیور همراه بود. هفده گونه هندی به ۱۳ STS اختصاص داده شد. ارتباط ژنتیکی بین گونه های گوساله ها ، کارگر لبنیات و محیط های مرتبط حاکی از انتقال بین میزبان و شیوع زونا است.