اهمیت قوم شناسی بسیاری از گیاهان دارویی به طور سنتی برای درمان اختلالات دستگاه گوارش مورد استفاده قرار می گیرند. مطابق تک نگاشتهای منتشر شده توسط کمیته محصولات دارویی گیاهی (HMPC) در آژانس داروهای اروپایی ، در حال حاضر ۴۴ گیاه دارویی در اتحادیه اروپا برای درمان اختلالات دستگاه گوارش بر اساس استفاده سنتی توصیه می شود. نشانه های اصلی اختلالات عملکردی و مزمن دستگاه گوارش مانند سوء هاضمه عملکردی و سندرم روده تحریک پذیر (IBS) است و از ویژگی های بارز این گیاهان می توان به تحریک ترشح معده ، اثرات اسپاسمولیتی و کرمی ، اثرات تسکین دهنده بر روی دستگاه گوارش ، اثرات ملین ، مهارکننده اشاره کرد. یا فعالیتهای ضد درد و اثرات ضد التهابی. فعلاً احتمالاً تعامل احتمالی با میکروبیوتیک روده انسان مورد توجه قرار نگرفته است ، اگرچه کاملاً محتمل است. هدف از مطالعه است در این بررسی ، ما با هدف شناسایی و ارزیابی مطالعات منتشر شده که به بررسی اثر متقابل این گیاهان با میکروبیوم روده پرداخته است. نتایج براساس این بررسی ، تنها بخش جزئی از ۴۴ گیاه دارویی که در تک نگاشتهای EMA برای درمان بیماریهای دستگاه گوارش در نظر گرفته شده است ، تاکنون با توجه به فعل و انفعالات احتمالی با میکروبیوتای روده مورد بررسی قرار گرفته است. ما می توانیم هشت مطالعه آزمایشگاهی مرتبط را که با شش مورد از این گیاهان دارویی انجام شده است شناسایی کنیم ، ۱۷ مورد آزمایش داخل بدن که در حیوانات آزمایشگاهی شامل هفت گیاه گیاهان دارویی و سه آزمایش در انسان با دو گیاه انجام شده است.