زمینه
شناسایی فراوانی کمی فیتوشیمیایی موجود در عصاره های گیاهی بسیار دشوار است. فعالیت دارویی مشاهده شده در چنین گیاهانی ناشی از یک ترکیب واحد نیست. در بیشتر موارد ، عصاره های گیاهی بر اساس اثرات هم افزایی یا آنتاگونیستی فعالیت خود را نشان می دهند. بنابراین ، ایده یک رویکرد جامع گرایانه منطقی تر است.
هدف
این مطالعه با هدف مقایسه پروفایلهای متابولیک و پروتئومیک Valeriana officinalis L. (Valerianaceae) ، Melissa officinalis L. (Lamiaceae) ، Hypericum perforatum L. (Hypericaceae) و Passiflora incarnata L. (Passifloraceae) که در اضطراب ضد اضطرابی و خواب استفاده می شود . تجزیه و تحلیل omics یکپارچه برای ارائه درک بهتر از اثر عصاره های گیاهی در سطح بیان فاکتور نوروتروفیک (BDNF) بر مغز مشتق شده بر روی خط سلولی SH-SY5Y با یک رویکرد جامع استفاده شد.
مواد و روش ها
پروفایل متابولومیکی گیاهان با استفاده از سیستم های GC-MS و LC-qTOF-MS و تجزیه و تحلیل پروتئوماتیک با استفاده از سیستم LC-qTOF-MS پس از هضم تریپسین انجام شد. از کیت ELISA Quantikine انسانی BDNF انسانی برای آزمایش فعالیت بیان BDNF در رده سلولی SH-SY5Y استفاده شد.
نتایج
عصاره های گیاهی مورد بررسی افزایش معنی داری در بیان BDNF نشان داد (۰۵/۰ p <). M. officinalis به عنوان فعالترین عصاره یافت شد. با توجه به تجزیه و تحلیل همبستگی بین فعالیت BDNF و متابولیک یا سطح پروتئومیکس ، 94 متابولیت با همبستگی مثبت و در حالی که 23 متابولیت یک همبستگی بسیار منفی دارند. پروتئین ها به ترتیب 24 و 6 هستند.
نتیجه
تجزیه و تحلیل داده های چند متغیره مشخصات متابولیک مشابه H. perforatum و P. incarnata ، که همچنین یک پروفایل فعالیت مشابه را نشان داد. شایان ذکر است ، تمام متابولیت های اصلی متعلق به چرخه Krebs (اسید سیتریک ، اسید فوماریک ، اسید سوکسینیک ، اسید پیرویو ، اسید مالیک و اسید مرکامالیک ، آنالوگ اسید مالیک) با فعالیت BDNF ارتباط مثبت داشتند. متابولیتهای ثانویه با بیان BDNF بالا متعلق به فلاونوئیدها ، زانتون ، کومارینها ، تانن ، نفتالین ها ، ترپنوئیدها و اسکلت کاروتنوئیدی است. دو پروتئین از خانواده سیتوکروم P450 (P450 71B11 و P450 94B3) با فعالیت BDNF ارتباط مثبت داشتند. استفاده از فن آوری های omics در منطقه تحقیقاتی گیاهان ، درک بهتری از نقش عصاره های گیاهی را ارائه می دهد و ممکن است منجر به کشف ترکیبات جدید با فعالیت خاص شود.