تمام اقدامات تهاجمی شامل تماس با دستگاه پزشکی یا ابزار جراحی با بافت استریل یا غشاهای مخاطی بیمار می باشد. میزان ضد عفونی یا عقیم سازی بستگی به کاربرد مورد نظر از جسم دارد. بحرانی (مواردی که با بافت استریل تماس می گیرند ، مانند ابزارهای جراحی) ، نیمه بحرانی (مواردی که به غشاهای مخاطی ارتباط دارند ، مانند آندوسکوپ) و غیر بحرانی (وسایلی که فقط با پوست دست نخورده مانند استتوسکوپ ها تماس می گیرند) به مواردی نیاز دارند که ضدعفونی شوند ، سطح ضد عفونی بالایی دارند ، و به ترتیب ضد عفونی سطح پایین. تمیز کردن همیشه باید قبل از ضد عفونی و عقیم سازی سطح بالا باشد.
ضد عفونی کننده ها به عنوان بخشی از برنامه بهداشت دست و همچنین سایر موارد استفاده مانند ضد جراحی دست و آماده سازی پوست قبل از عمل ، برای جلوگیری از عفونت ضروری هستند.