Poppy Persian (Papaver bracteatum L.) یک گیاه دارویی بی نظیر آلپی است. این گیاه یک منبع نادر از گیاه تریاک مخدر در طبیعت است. Thebaine یک آلکالوئید پیش ساز درمانی با ارزش است. هفت آغازگر ISSR و ده ترکیب آغازگر AFLP برای بررسی تغییرات ژنتیکی ۶۷ ژنوتیپ P.bracteatum تازه از ۹ جمعیت وحشی در سراسر ایران جمع آوری شد. در کل ۵۲٪ ISSR و ۴۸٪ پلی مورفیسم ژنتیکی AFLP در بین جمعیت ها مشاهده شد. تنوع ژنتیکی در جمعیت توسط مارکرهای ISSR و AFLP 38٪ و ۴۱٪ بود. میانگین ضریب تمایز ژن (Gst) 0.54 (ISSR) و ۰٫۵۲ (AFLP) بود. Geneflow 0.413 (ISSR) و ۰٫۴۷۰ (AFLP) بود. AMOVA تنوع بالاتر در جمعیت را تأیید کرد. AFLP و ISSR به طور مشابه ، دسترسی P. bracteatum را به سه گروه اصلی و یک گروه جزئی ، که با توزیع جغرافیایی نمونه ها در ارتباط بود ، از هم جدا کردند. هر دو نشانگر بطور قاطع تفاوت الحاق خارج از گونه را نشان داده و الحاق ناشناخته را به عنوان P. oreintale مشخص کردند. AFLP با قدرت تفکیک نشانگر میانگین بالاتر (Rp = 9.74) در آشکار سازی تغییرات ژنتیکی گونه های Papaver مؤثرتر بود. تنوع ژنتیکی متوسط ​​در جمعیت ، و تغییر بسیار زیاد و وضعیت ظاهری در میان جمعیت می تواند عمدتاً ناشی از عوامل انسانی باشد. محافظت از گونه ها با اجرای برنامه های حفاظت از محیط در خارج از کشور بسیار مهم است. از نتایج این مطالعه می توان برای مطالعات مولکولی ، برنامه های اصلاح و نگهداری استفاده کرد.